Emboss est un package de logiciels pour la bioinformatique en open source. J'ai il y a quelques mois optimise un des composants d'emboss, water. Water compare des sequences par Smith Waterman.

L'optimisation permetait tout de meme d'aller 12x plus vite sans changer le materiel, pas rien. Donc je lance mes resultats sur la mailling list de leur site, en demandant des avis et une revue des resultats.

Et dans les 48h apres, comme par hasard, un mail de Sun sur la meme liste propose de travailler sur emboss et demande des avis sur quoi cibler. Je suis MORT DE RIRE ! Vils copieurs ;-) !

Enfin bon tout ca c'est bon pour emboss, si tout le monde commence a l'optimiser ca sera mieux.

Mes slides et les sources